به منظور تحقق بخشی از وظایف پژوهشی دانشگاه اردکان و نیز کمک به رفع نیازهای پژوهشی کشور در زمینه  علوم تولید مثل دام و بیولوژی سلولی-مولکولی، پژوهشکده بیولوژی و علوم تولید مثل دام وابسته به دانشگاه اردکان براساس مجوز هیأت امنای دانشگاه‌های استان، طبق مفاد اساسنامه، قوانین، مصوبات و مقررات مربوط تأسیس و اداره می‌گردد.

اهدف و وظایف
برخی از اهداف‌ای مرکز شامل:

• ایجاد و راه‌اندازی؛ پژوهش‌های مرتبط با زیست‌شناسی تولیدمثل و انواع سرطان‌های دستگاه تولیدمثل
• ایجاد و راه‌اندازی مرکز آموزشی-ترویجی یافته‌های علمی در سطح ملی و تربیت پژوهشگران علاقه‌مند، انجام مطالعات Clinical trial در راستای ادامه پژوهش‌های مرکز و تجاری سازی نتایج پژوهش‌ها، دریافت پژوهانه‌های پژوهشی
• راه‌اندازی پژوهشکده‌ی مطالعات تجربی- مقایسه‌ای در مرکز کشور به منظور بررسی بیماری‌های عفونی و غیرعفونی به صورت تجربی، ارائه خدمات تخصصی دامپزشکی، انجام مطالعات مقایسه ای- درمانی در مدل‌های حیوانی و  مدل‌سازی حیوانات
• ایجاد و راه‌اندازی آزمایشگاه‌های تخصصی به منظور بررسی آزمون‌هایی نظیر بقاء، تکثیر و مرگ سلولی (آپوپتوز) ، سمّیت، التهاب‌زایی و تحریک رشد بر روی سلول‌های مختلف، ارزیابی آسیب DNA اسپرم، بررسی‌های سرلوژیک اعم الایزا و ایمنوفلورسانس، تست‌های آنتی باکتریال، تست‌های مولکولی از قبیل انواع پی سی آر و  Realtime PCR، تولید فراورده‌های بیولوژیک از قبیل انتی ژن و پروتئین، آزمون‌های وابسته به روند رهایش دارو و تعیین غلظت مواد در محلول‌ها، هیستولوژی مقطع بیضه و تخمدان رت صحرائی و سایر حیوانات ازمایشگاهی
• همکاری با مراکز و شرکت‌های دارویی به منظور تهیه داروهای نوترکیب و جایگزین جهت درمان بدخیمی‌ها                                          

محل فعالیت
محل فعالیت پژوهشکده در داخل دانشگاه اردکان ، دانشکده پیرادامپزشکی می‌باشد.

اعضای پژوهشکده
• رئیس
• معاون پژوهشی
• شورای پژوهشی
• گروه‌‌های پژوهشی
• مدیران گروه‌های پژوهشی


رئیس 
رئیس پژوهشکده، که نماینده قانونی پژوهشکده نزد مراجع حقیقی و حقوقی است، از میان اعضای هیأت علمی صاحبنظر دانشگاه در زمینه‌های مرتبط با دامپزشکی و بیولوژی، با حکم رئیس دانشگاه به مدت دو سال منصوب می‌شود. انتصاب مجدد وی بلامانع است. در حال حاضر آقای دکتر امین احمدی عضو هیات علمی گروه علوم پایه به عنوان سرپرست پژوهشکده فعالیت دارند.


وظایف و اختیارات رئیس
• برنامه‌ریزی، هدایت، اداره پژوهشکده و نظارت بر فعالیت‌های آن
• نظارت بر حسن اجرای طرح‌های پژوهشی و سایر وظایف پژوهشکده
• پیشنهاد انتصاب مسؤولان پژوهشکده بر اساس تشکیلات مصوب
• تشکیل شوراهای مورد نیاز برابر ضوابط و مقررات دانشگاه
• ایجاد ارتباط منظم و سازنده میان پژوهشکده و سایر بخش‌های داخل و خارج دانشگاه برابر ضوابط و مقررات دانشگاه
• تنظیم و ابلاغ بخشنامه‌ها ودستورالعمل‌های مورد نیاز پژوهشکده درحدود اختیارات قانونی
• ارائه گزارش عملکرد سالیانه به رئیس دانشگاه
• تنظیم و پیشنهاد برنامه سالانه و چند ساله به شورای پژوهشی پژوهشکده
تبصره: رئیس پژوهشکده می تواند بخشی از وظایف واختیارات خود را  با حفظ مسئولیت و با تأیید رئیس دانشگاه، به معاون پژوهشی پژوهشکده تفویض نماید.


ترکیب شورای پژوهشی
• رئیس پژوهشکده (رئیس شورا)
• معاون پژوهشی پژوهشکده (نایب رئیس و دبیر شورا)
• مدیران گروه‌های پژوهشی پژوهشکده
• دو تا پنج تن از متخصصان صاحبنظر در زمینه فعالیت‌های تخصصی پژوهشکده
تبصره ۱- اعضای مذکور دربند ۴ به پیشنهاد رئیس پژوهشکده و تأیید و حکم رئیس دانشگاه به مدت دو سال منصوب می‌شوند.


وظایف و اختیارات شورای پژوهشی 
• تدوین سیاست‌ها و برنامه‌های علمی- پژوهشی پژوهشکده
• بررسی و تصویب طرح‌های پژوهشی پژوهشکده و نظارت برحسن اجرای آنها
• برنامه‌ریزی برای ایجاد و تعمیق ارتباط علمی با سایر مؤسسات و نهادهای علمی پژوهشی کشور برابر با ضوابط و مقررات دانشگاه
• بررسی و تصویب برگزاری کارگاه‌ها ودوره‌های آموزشی پژوهشی کوتاه مدت و همایش‌های علمی در چهارچوب وظایف پژوهشکده
• ارزیابی نتایج طرح‌های توسعه‌ای و پژوهشی و عملکرد کارگاه‌ها ودوره‌های آموزشی پژوهشی کوتاه مدت پژوهشکده
• بررسی و تعیین نیازهای تجهیزاتی، انتشاراتی، اطلاعاتی و علمی پژوهشکده
• نظارت بر انتشار کتاب، مجله و سایر منابع اطلاعات علمی پژوهشکده


وظایف و اختیارات مدیران گروه‌های پژوهشی
• تعیین دورنمای فعالیت گروه، برنامه‌ریزی، هدایت و اداره گروه در جهت پیشبرد اهداف پژوهشکده
• تنظیم و پیشنهاد برنامه سالانه و چند‌ ساله برای گروه 
• نظارت بر حسن اجرای طرح‌های پژوهشی گروه
• برگزاری جلسات منظم با اعضای گروه 
• ارائه گزارش عملکرد ماهیانه به رئیس پژوهشکده


گروه‌های پژوهشی
بیولوژی و علوم تولیدمثل دام دانشگاه اردکان شامل سه گروه پژوهشی زیر می باشد:

1. گروه مطالعات تجربی- مقایسه‌ای

2. گروه زیست‌شناسی تولیدمثل و IVF

3. گروه زیست‌فناوری

منابع مالی
• درآمدهای حاصل از اجرای طرح‌های پژوهشی، ارائه خدمات مشاوره‌ای، برگزاری کارگاه‌ها و دوره‌های آموزشی پژوهشی کوتاه‌مدت و عرضه محصولات علمی پژوهشکده (کتاب، مجله و...)
• کمک‌های دریافتی از وزارتخانه‌ها و دستگاه‌های مرتبط از جمله وزارت جهاد کشاورزی، استانداری، ریاست جمهوری و …
• هدایا و کمک‌های دریافتی از اشخاص حقیقی و حقوقی
• اعتبارات بودجه عمومی